Né à Marseille, Yannis Pouspourikas part étudier au Conservatoire supérieur de Genève puis à l’Opéra de Zurich où il obtient un premier prix de direction d’orchestre à l’unanimité du jury. Après ses débuts à Genève où il dirige Die Fledermaus en 1999, il est nommé chef assistant par Sir Simon Rattle au Festival de Glyndebourne. 

De 2002 à 2004, il occupe le même poste  à l’Opéra National de Paris. En 2004, il est nommé chef résident de l’Orchestre national de Lyon, en outre, il est nommé en 2005 chef associé de l’Orchestre symphonique de Mulhouse, poste qu’il occupera pendant quatre saisons. En septembre 2008, Yannis Pousspourikas est nommé directeur musical à l’Opera Ballet Vlaanderen où il dirige un répertoire très diversifié, allant des Nozze di Figaro à des titres plus contemporains comme Peter Grimes, Candide, Love for Three Oranges ou encore Elektra. Jusqu’en 2017, il était également associé en tant que chef d’orchestre avec l’Aalto-Theater à Essen. Les temps forts de la saison 2020/2021 sont ses représentations régulières au Theater Erfurt ainsi que la nomination au poste de Chef de l’Orchestre symphonique de Bienne Soleure et au poste de Directeur des concerts du Théâtre Orchestre Bienne Soleure (TOBS) pour la saison 2022/2023.